Başlıca araştırma ilgi alanım RNA analizi. Temel odak noktası ise, hedef mesajcı RNA'larına (mRNA'lar) bağlanma yoluyla transkripsiyon sonrası gen ekspresyonunu düzenleyen küçük (~ 22-nt) kodlayıcı olmayan RNA'lar olarak bilinen mikroRNA'lar (miRNA'lar) üzerinedir. Araştırmamın tüm deneyleri in silico (bilgisayar ortamında) gerçekleştirilmektedir ancak meslektaşlarımın laboratuvardan elde ettikleri sonuçları değerlendirmelerine de yardımcı olmaktayım. MiRNA analizi için kullanılan yöntemler şunlardır:1) bir genomdan tüm aday miRNA öncüllerinin tahmin edilmesi, örneğin, insan genomunun milyonlarca saç tokası yapısında miRNA üretme potansiyeli vardır, 2) bu miRNA'ların hedef genlerini aramak, örneğin insan genlerinin çoğunluğu miRNA'lar tarafından düzenlenir, 3) çeşitli hastalık fenotiplerindeki rolleri dâhil olmak üzere miRNA eylemlerinin biyolojik sonuçlarını araştırmak gibi fonksiyonel analizler, 4) konak ve patojen arasındaki miRNA bazlı iletişimi gösteren âlemler arası düzenleme analizleri ve 5) makine öğrenimi (ML), örneğin miRNA verisine ML yaklaşımlarını uygulamak ve yeni iş akışları tasarlamak gibi analizler. İletişim Bilgileri: E-mail: duygu.sacar@agu.edu.tr Telefon: +90 352 224 88 00 (7389)
|
|
- E-Posta:yoshiaki.ohkubo@agu.edu.tr
- AVES Sayfasıhttp://aves.agu.edu.tr/yoshiaki.ohkubo